Gillian se během natáčení první série seznámila s výtvarníkem Clydem Clotzem a po čtyřech měsících známosti se za něj provdala na Hawaii. Krátký čas nato zjistila , e je těhotná. Kdy se v únoru (1994) dověděla o svém těhotenství, byla to kombinace holého faktu a poehnání.
Byla to báječná zpráva, ale vyděsila mnoho lidí. Mě také. Seriál se dobře rozbíhal, ale byl stále velmi mladý a mohl se ubírat různými směry. Vechno mohlo tak trochu mojí vinou ztroskotat. Bylo to těké dát ostatním najevo, jak jsem se rozhodla, ale také pro ně, zda nemají obsadit roli někým jiným. Znepokojená vyhlídkou na moné přeobsazení své role se s touto novinou nejprve svěřila Duchovnymu, a pak reisérovi a producentovi Chrisu Carterovi. Rozhodnutí padlo okamitě - podřídit natáčení jejímu těhotenství. Trvalo dalí měsíce, ne prozradila tábu a tisku pravdu o svém stavu. Omezení účasti Andersonové na natáčení přineslo nemalé problémy. Nezbytnost zakrýt známky těhotenství a její odepsání na několik epizod vedla k některým nejvíce paranoidním příběhům: uzavření projektu Akta-X, její únos, role pokusného králíka ve vládním experimentu s mimozemskou DNA. Autoři se snaili co nejvíce se přizpůsobit situaci a to také vedlo k tomu, e jsem se vrátila. Rozhodnutí Andersonové pracovat a do posledního týdne před plánovaným porodem vyvolalo u jejích spolupracovníků obdiv. Logistika filmování byla spí strádáním pro reiséry a jejich asistenty, kteří museli vypočítat, z jakého úhlu ji budou snímat, aby zakryli fyzické změny. Andersonová přiznává, e přibývající měsíce pro ni byly čím dál tím větím utrpením. Otékaly mi nohy, cítila jsem se vyčerpaně, usínala jsem mezi jednotlivými scénami. Vzpomíná, jak jí členové tábu přináeli bedničky od jablek, aby si měla kam sednout. Spí to vypadalo, jako by byl těhotný celý táb. Tak byli pozorní a ohleduplní. Dcera Andersonové, Piper, se narodil v srpnu 1994. Přila na svět císařským řezem, který nikdo nepředpokládal, a který vyadoval, aby herečka strávila v nemocnici est dnů navíc. Čtyři dny poté u natáčela scény pro epizodu Jedním dechem. Byly to pro mě těké chvíle, svěřuje se Andersonová, protoe jakočerstvá matka, a chcete nebo ne, neustále se zabýváte otázkou, co právě v tuhle chvíli dělá vae dítě. Byla to nesnesitelná psychická zátě, ale věděla jsem,e lidem, kteří mě podreli, něco dluím, a proto musím pokračovat dál. Nyní má Andersonová dvojnici, která provádí fyzicky náročnějí scény.Jakkoli bych chtěla, moje tělo jetě není úplně v pořádku. Ve je stále trochu nevyrovnané. I kdy jen chodím po schodech, bolí mě kolena. Natěstí po mě nechtějí příli namáhavé věci.